皇甫谧(陈浩民 饰)回到神针堂，还未把事情告诉香苓(王鸥 饰)之时，梁柳(肖聪 饰)就派人送了一个猪头前来，让皇甫谧和香苓看了都尴尬一笑。皇帝确信丽妃(王泫伊 饰)所怀的孩子不是自己的，可因为司马魁(陈继铭 饰)手握重兵，他一时半会没办法动丽妃，免得兵变危及他的江山社稷，他只能把此事暂时隐忍下来。皇甫谧将丽妃怀孕两个月，可能此孕与梁柳有关的事情告诉香苓，同时跟香苓商量是否进宫当御医主管的事情。香苓觉得，皇甫谧没有将丽妃怀孕实情说出来，他日真相大白之后，皇帝一定会向皇甫谧问责，所以她让皇甫谧还是不要进宫较为安全，皇甫谧也同样觉得他不能进宫。城外瘟疫蔓延，城内百姓纷纷跑到神针堂求药，可神针堂只是医馆并没有药材可卖，百姓们只能围着神针堂不肯离开。皇甫谧前来解围，在听取了众百姓的描述之后，让他们回去按照自己的办法消毒，不要因为疫情还没有蔓延到城内就制造恐慌。皇帝头疼瘟疫之事，把此事交给司马魁去处理，让司马魁想办法将疫情解除，可没想到司马魁选择的方法却是将感染疫情的人全部掩埋掉。皇甫谧前往城外查看疫情，正好看到司马魁掩埋尸体，其中还有春生的奶奶，而春生奶奶还有一口气并没有死，皇甫谧于是偷偷把春生奶奶带回神针堂医治。皇甫谧给春生奶奶施针之后，让大师兄抓药给春生奶奶治病，而他则直接进宫找皇帝说明疫情的蔓延情况。皇甫谧请命要去城外解决疫情，皇帝却认为皇甫谧是在危言耸听，因为他已经派人了解了情况，认为疫情已经受到了控制，所以他不准皇甫谧的请求。皇帝看皇甫谧非常坚持，便逼迫皇甫谧做选择，让皇甫谧答应当御医主管，他便准许皇甫谧出城治病。皇甫谧不敢把司马魁做的事情直接告诉皇帝，可他又不肯当御医主管，只能再次惹怒皇帝，抗旨不遵。梁柳得知皇甫谧再次得罪皇帝，心里特别的开心，于是命高升将百姓所需的消毒药材全部提高五倍的价格，同时去向司马魁报告这个好消息。司马魁得知皇帝不相信皇甫谧的话，相信他处理好了疫区的事情，于是跟梁柳商量着，如何借此次的疫情，将皇甫谧置于死地。布准(樊少皇 饰)和香苓都认为，救城外的百姓要紧，让皇甫谧同意进宫当官，得到皇帝的允许出城治病，可皇甫谧却还是犹豫不决。梁柳想让皇甫谧进退两难，主动去向皇甫谧示好，想让皇甫谧跟他一起去治瘟疫，好让皇甫谧死在疫区回不来。皇甫谧对梁柳的突然转性半信半疑，听到梁柳愿意帮他到皇帝面前求情，他这才答应跟梁柳合作一起去疫区治病，然后把自己亲自写的信转交给梁柳递呈给皇帝。梁柳给皇甫谧送了一批珍贵的药材，皇甫谧于是让人把药材拿到草春堂，更换治瘟疫的药材。梁柳和司马魁表面上向皇帝求情，帮皇甫谧申请去疫区，实则添油加醋惹怒了皇帝，气得皇帝直接下令封了神针堂。皇甫谧还未把药材配好送到疫区，就得知神针堂被封，让他很是郁闷，而梁柳则在此时前来神针堂，再次添油加醋，想让皇甫谧再抗旨逃出神针堂去。皇帝见到奏折得知瘟疫还没有得到控制，逼问前去帮他查看的李明全，才得知李明全并没有查看清楚，于是命王赞前往疫区调查。皇甫谧因为不能去疫区治病，在神针堂内喝酒买醉，所有人劝他都劝不了，这时嵇康前来骂了皇甫谧一顿，将他给骂醒了。皇甫谧被骂醒之后，便写信向皇帝认错，同意进宫当官，皇帝这才开心地解封，同意皇甫谧去疫区缓解疫情。